Deildir skólans eru fjórar:
- Engi, Bakki, Brekka og Akur.
- Í austurhluta hússins eru yngri deildirnar Engi og Bakki.
- Í vesturhluta hússins eru eldri deildirnar Akur og Brekka.
Arnarsmári er opinn leikskóli, þ.e. að deildirnar eru ekki mjög stórar, en stór svæði skólans eru samnýtt af öllum deildum, s.s.listasmiðja, leiksmiðja, hreyfisalur og holukubbar. Í miðju hússins er matsalur sem er nýttur af öllum deildum leikskólans.