Deildir skólans eru fimm:

  • Engi, Bakki, Brekka, Akur og Gulldeild.
  • Í austurhluta hússins eru yngri deildirnar Engi og Bakki.
  • Í vesturhluta hússins eru eldri deildirnar Akur og Brekka.
  • Gulldeild er í hreyfisalnum.

Arnarsmári er opinn leikskóli, þ.e. að deildirnar eru ekki mjög stórar, en stór svæði skólans eru samnýtt af öllum deildum, s.s. hreyfisalur, listasmiðja, leiksmiðja og holukubbar. Í miðju hússins er matsalur sem er nýttur af öllum deildum leikskólans.